Священная Британская Империя занимает одну треть всего мира и является самым могущественным государством. Британия нападает на Японию и в ходе непродолжительной войны Япония теряет свой суверенитет и входит в её состав, переименовываясь в Зону 11. Жители Японии отныне зовутся "одиннадцатыми" и подвергаются дискриминации.
2017 год. Молодой британец, ученик Академии Ашфорд, Лелуш Ламперуж случайно попадает в разборку между британскими солдатами и японскими террористами. Совершенно случайно он находит в машине террористов капсулу с девушкой, которая защищает его своим телом, когда того пытаются убить, а затем получает от неё особую силу - Гиасс, которая позволяет подчинить себе любого человека. Лелуш также узнает правду о себе: он - одиннадцатый принц и семнадцатый наследник на Британский трон, и решает отомстить за смерть своей матери, а заодно создать мир, в котором его сестра, Наналли, будет жить счастливо.
Лелуш атакует британскую армию в Синдзюку, предоставив группе повстанцев "одиннадцатых" несколько найтмаеров и стратегическую поддержку. По этой причине принцу Кловису пришлось отдать приказ об использовании экспериментального KF «Ланселот», который пилотировался Судзаку. «Ланселот» был гораздо более продвинутой моделью УН по сравнению с предыдущими поколениями, и Лелуш вынужден был изменить свой план.
Он убивает принца Кловиса, так и не сумев узнать от него, кто же убил его мать.

Действие нашей игры начинается сразу же после этих событий, на следующий день, когда в Японию прибывает часть Королевского Семейства (состав уточняется) вместе с Рыцарями Круглого Стола в связи с всемирной конференцией по вопросам безопасности, на которую были приглашены правительства всех мировых держав.
На данный момент о смерти принца Кловиса знает лишь Тод (глава армии при принце, руководитель секретных опытов, проводившихся над С.С.) и Лелуш Ламперуж.